人類への復讐心を燃やし、20年以上もの間、地下に潜伏していた教授。ついに究極の人型兵器、A-00GRを完成させた。しかし、地上に姿を現した時、世界は既に滅亡していた――。文明の廃墟の中、A-00GRと教授は、人類の「感情」を再発見する旅に出る。